そのプロパティ自体は、AAA.jsとBBB.jsをリソースとしている場合などに
AAA.jsとBBB.jsをマージしたtemp.jsとして提供するというような内容なので
本来はPG動作には影響しないものだと思います。
ただし、それぞれのスクリプト内で
--- AAA.js ---
function loading() {
:
}
--- BBB.js ---
function loading() {
:
}
などの定義があった場合に、読み込み順でどちらが有効になるかが変わるので
その影響で挙動が変化することはあるかもしれません。
逆にONにすることでライブラリ内(あるいはライブラリ同士)の参照が
うまくいかなくなり動作しなくなることはよくあります。
--- LibAAA.js ---
document.write("<script type="javascript" src="/sub/LibAAASubBBB.js"/>");
javascriptでしたら、デバッグも用意(IEでしたら開発者ツールのScriptタグ)ですので
"何故かはわからないけどこうすれば動く"ではなく
なにが原因でエラーとなっていて、チェックすることで何故動くようになっているのか
しっかりお調べになったほうが後々役立つかと思われます。